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91.
景观格局变化一直是景观生态学研究的核心问题之一,也是相关生态和环境过程研究的基础.本文应用3S技术,综合传统的空间统计分析、转移矩阵、景观指数和景观动态指数、Kappa指数系列,并引入模糊Kappa指数方法,以铁岭市2002-2011年间景观格局变化为例进行了综合研究.结果表明:铁岭市景观空间格局在研究时段内发生一定程度的变化.旱地面积大幅增加,水田面积明显减少,各景观类型之间均有相互转化.景观格局总体的变化趋势是形状趋于复杂、异质性增加、破碎化加剧,人为干扰的影响较明显.研究区域2002-2007年综合景观动态度指数明显高于2007-2011年,景观动态总体呈现放缓趋势.通过Kappa指数系列可知,研究时段内研究区景观变化由景观类型之间变化为主逐渐转变为各类斑块位置上的变化为主.应用多种方法进行综合分析更能全面有效地反映景观格局变化.  相似文献   
92.
93.
本文研究了华北棉花-玉米农田景观格局中龟纹瓢虫Propylaea japonica(Thunberg)和异色瓢虫Harmonia axyridis(Pallas)种群动态,发现农田景观格局中作物类型(棉花与玉米)对两种瓢虫种群密度动态有显著的影响,两种天敌瓢虫都趋向在玉米斑块上栖息。两种瓢虫在棉花斑块上呈现出时间分化,其中龟纹瓢虫在棉花种植的前中期种群密度较大,后期较少;而异色瓢虫在棉花前中期种群密度较少,后期较多,表明农田景观中种植玉米有利于增强瓢虫对棉花害虫的控制作用。进一步的研究表明,农田景观系统中玉米斑块所占的面积比对龟纹瓢虫和异色瓢虫种群密度均产生显著影响。这说明在农田景观系统中开展区域性生态调控的时候,需要考虑到各类斑块组合的面积比例,从而有利于增强多种天敌昆虫的协调控害作用。  相似文献   
94.
In today’s world, the pursuit of a novel anti-cancer agent remains top priority because of the fact that the global burden of this malady is continuously increasing. Our work is no different from others in searching for new therapeutic solutions. To achieve this, we are looking into Epigenetics, the phenomenon governed by hypermethylation and hypomethylation of tumor suppressor genes and oncogenes, respectively. Our target for this study is an important intermediary methyl-CpG binding protein named kaiso. In our study, we have used the X-ray crystallographic structure of Kaiso for virtual screening and molecular dynamics simulations to study the binding modes of possible inhibitors. The C2H2 domain comprising LYS539 was used for screening the inter bio screen Database having 48,531 natural compounds. Our approach of using computer-aided drug designing methods helped us to remove the execrable compounds and narrowed our focus on a selected few for molecular simulation studies. The top ranked compound (chem. ID 28127) exhibited the highest binding affinity and was also found to be stable throughout the 20 ns timeframe. This compound is therefore a good starting point for developing strong inhibitors.  相似文献   
95.
Abstract

Reaching the experimental time scale of millisecond is a grand challenge for protein folding simulations. The development of advanced Molecular Dynamics techniques like Replica Exchange Molecular Dynamics (REMD) makes it possible to reach these experimental timescales. In this study, an attempt has been made to reach the multi microsecond simulation time scale by carrying out folding simulations on a three helix bundle protein, Villin, by combining REMD and Amber United Atom model. Twenty replicas having different temperatures ranging from 295 K to 390 K were simulated for 1.5 μs each. The lowest Root Mean Square Deviation (RMSD) structure of 2.5 Å was obtained with respect to native structure (PDB code 1VII), with all the helices formed. The folding population landscapes were built using segment-wise RMSD and Principal Components as reaction coordinates. These analyses suggest the two-stage folding for Villin. The combination of REMD and Amber United Atom model may be useful to understand the folding mechanism of various fast folding proteins  相似文献   
96.
Proteins are dynamic entities in cellular solution with functions governed essentially by their dynamic personalities. We review several dynamics studies on serine protease proteinase K and HIV-1 gp120 envelope glycoprotein to demonstrate the importance of investigating the dynamic behaviors and molecular motions for a complete understanding of their structure–function relationships. Using computer simulations and essential dynamic (ED) analysis approaches, the dynamics data obtained revealed that: (i) proteinase K has highly flexible substrate-binding site, thus supporting the induced-fit or conformational selection mechanism of substrate binding; (ii) Ca2+ removal from proteinase K increases the global conformational flexibility, decreases the local flexibility of substrate-binding region, and does not influence the thermal motion of catalytic triad, thus explaining the experimentally determined decreased thermal stability, reduced substrate affinity, and almost unchanged catalytic activity upon Ca2+ removal; (iii) substrate binding affects the large concerted motions of proteinase K, and the resulting dynamic pocket can be connected to substrate binding, orientation, and product release; (iv) amino acid mutations 375 S/W and 423 I/P of HIV-1 gp120 have distinct effects on molecular motions of gp120, facilitating 375 S/W mutant to assume the CD4-bound conformation, while 423 I/P mutant to prefer for CD4-unliganded state. The mechanisms underlying protein dynamics and protein–ligand binding, including the concept of the free energy landscape (FEL) of the protein–solvent system, how the ruggedness and variability of FEL determine protein’s dynamics, and how the three ligand-binding models, the lock-and-key, induced-fit, and conformational selection are rationalized based on the FEL theory are discussed in depth.  相似文献   
97.
张华兵  刘红玉  侯明行 《生态学报》2013,33(15):4767-4775
将盐城国家级自然保护区核心区划分为人工管理区和自然湿地区两种模式,根据2000年、2006年、2011年3个时相的ETM+影像,运用RS、GIS技术和景观生态学方法,分析不同驱动力下互花米草沼泽景观变化的差异.结果表明:(1)人工管理区,2000-2011年,互花米草沼泽面积由272hm2增加到781hm2;平均分维数呈下降的趋势,聚合度指数呈上升的趋势,表明互花米草沼泽在空间上趋于聚集,在形状上趋于规则;从互花米草沼泽增长速率看,2000-2011年,呈现先快后慢的特征.在景观空间演变上,互花米草沼泽的平均宽度从598.679m增加到1719.002m,表现出向海陆两个方向扩张的特征.(2)自然湿地区,2000-2011年互花米草沼泽面积由2023hm2增加到3974hm2;平均分维数和聚合度指数呈先上升后下降的趋势;米草沼泽增长稳定,年增长约160-180 hm2/a,单位长度岸线年增长面积约为15 hm2· km-1·a-1左右;比较发现,自然湿地区互花米草沼泽的增长速度高于人工管理区的增长速度.在景观空间演变上,互花米草沼泽平均宽度从1625.586m增加到3193.317m,2000-2006年表现出向海洋单方向扩张的特征,2006-2011年表现出向海陆两个方向扩张的性质.(3)在自然条件下互花米草沼泽扩张受到气候、地貌过程、水文过程、植被类型及种间竞争的影响,表现出明显的带状特征.在人工管理下,通过建设拦水堤坝等,阻止了潮汐作用下海水的扩散能力,生态过程发生改变,致使生态系统类型向淡水湿地方向演变,抑制了互花米草沼泽的扩张,表现出一定的镶嵌格局.  相似文献   
98.
京沪穗三地近十年夜间热力景观格局演变对比研究   总被引:5,自引:2,他引:3  
孟丹  王明玉  李小娟  宫辉力 《生态学报》2013,33(5):1545-1558
城市热环境是城市生态环境的重要方面,它与城市气候、城市生态、城市灾害有着重要的联系.以北京、上海、广州三地为研究区,选取近10年MODIS的夜晚地表温度(LST)产品MOD11A2,分别采用质心迁移、景观格局指数、空间自相关方法研究京沪穗三地近10年的不同等级热力景观质心迁移演变、格局变迁和空间集聚特征.主要结论为:三地热力景观随郊区向市中心趋近,体现了由低温区、次中温区向中温区、次高温区、高温区过渡的趋势;三地的中温区所占比例最大,城市热力景观破碎度三地中上海市最高,5种热力景观比较,次中温区和高温区的破碎度最高;城市热力景观离散度三地中北京市最高,低温区和高温区的离散度较高.热环境空间自相关分析表明三地均以高温-高温区,低温-低温区集聚为主,北京、广州高温-高温区分布于南部,且集中成片分布,而上海市高温-高温区分布比较离散,相对较为复杂.从分布面积来说,10a中北京、上海表现为先减少后增加,而广州则持续减少.总体而言北京热环境恶化,而广州、上海热环境有所好转.  相似文献   
99.
黑河中游湿地景观破碎化过程及其驱动力分析   总被引:9,自引:0,他引:9  
赵锐锋  姜朋辉  赵海莉  樊洁平 《生态学报》2013,33(14):4436-4449
在遥感和GIS技术支持下,基于1975-2010年长时间序列遥感影像,选取斑块密度指数(PD)、景观内部生境面积指数(IA)、斑块平均面积指数(MPS)、斑块形状破碎化指数(FS1、FS2)等具有典型生态意义的景观指数模型,系统分析了黑河中游湿地景观的破碎化过程,并结合灰色关联分析、主成分分析等方法,探讨了影响研究区湿地景观破碎化过程的各驱动因子.结果表明:近35年来,研究区湿地景观破碎化主要表现为斑块平均面积的萎缩,斑块密度的上升以及斑块形状破碎化指数的增大.整个研究时段内,研究区湿地斑块平均面积减少了48.95hm2,斑块密度的上升0.006个/hm2;导致黑河中游湿地景观破碎化发生和发展的驱动力包含自然和人文两个方面.自然因子对湿地景观破碎化进程的影响则主要体现在气温和降水上,而且气温对湿地景观破碎化进程的影响程度明显大于降水.但在1975-2010年间的这一较小时间尺度上,人类活动对湿地景观破碎化的贡献率明显高于自然因子,人类活动能力的增强以及影响范围的不断扩大是引发黑河中游湿地景观破碎化的主因.  相似文献   
100.
关晓庆  刘军和  赵紫华 《生态学报》2013,33(14):4468-4477
农业景观格局与过程能够强烈影响寄生蜂对寄主的寻找及寄生作用,寄主密度亦是影响寄生蜂分布的重要因素,然而农业景观的格局和寄主密度对寄生蜂寄生率的相互影响是一项值得研究的工作.在简单与复杂2种麦田农业景观结构下,调查了麦蚜的分布格局与2种寄主密度下麦蚜的初寄生率与重寄生率,分析了景观结构对麦蚜密度的影响、景观格局与麦蚜密度对寄生蜂寄生率与重寄生率的影响及交互作用.结果表明:景观结构的复杂性对麦蚜分布和寄生蜂初寄生率与重寄生率的影响均不明显,但寄主密度与景观结构的复杂性对寄生蜂的影响存在着明显的交互作用,寄主密度与寄生率呈正相关,寄主密度较低时烟蚜茧蜂为优势种,寄主密度较高时燕麦蚜茧蜂为优势种.麦蚜初寄生蜂与重寄生蜂对寄主密度的反应与其形态学、体型大小以及生活史特征相关,初寄生蜂与重寄生蜂的群落组成显著影响其对麦蚜的寄生率,而与景观结构的复杂性关系不大.  相似文献   
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